Клеточные и молекулярные механизмы морфогенезов у губок (Porifera)

Губки (тип Porifera) занимают ключевое филогенетическое положение в животном царстве, а работ по морфогенетическим процессам у них – на порядки меньше, чем на дрозофиле. Мы изучаем механизмы, связывающие генотип и фенотип – события на уровне клеток и молекул, которые в ходе морфогенезов (эмбрионального и постэмбрионального развития, регенерации, метаморфоза) обеспечивают морфологическое воплощение генетической информации. Основной интерес для нас представляет вопрос, как клетки в ходе морфогенетических процессов «понимают» что делать? Какие сигнальные механизмы обеспечивают эти процессы? Как определяются оси (передне-задняя, апикально-базальная) в развитии, нарушенная при механическом повреждении, или при развитии конгломерата соматических клеток? Понимание на молекулярно-генетическом уровне этих процессов, происходящих в онтогенезе Porifera, дает совершенно новый подход к интерпретации данных об эволюции низших Metazoa.
В нашем распоряжении имеется транскриптом модельного вида, Halisarca dujardini; в сотрудничестве с зарубежными коллегами идет секвенирование и сборка генома, секвенирование транскриптомов разных типов клеток. Ведется работа по изучению Wnt и TGFbeta сигнальных путей в развитии, регенерации и формировании примморф.

Состав группы:

Александр Вадимович Ересковский, д.б.н., профессор кафедры эмбриологии СПбГУ
Илья Евгеньевич Борисенко, ассистент кафедры эмбриологии СПбГУ

Публикации:

1. Ereskovsky AV, Richter DJ, Lavrov DV, Schippers KJ, Nichols SA. Transcriptome sequencing and delimitation of sympatric Oscarella species (O. carmela and O. pearsei sp. nov) from California, USA. PLoS One. 2017 Sep 11;12(9):e0183002. doi: 10.1371/journal.pone.0183002

2. Fierro-Constaín L, Schenkelaars Q, Gazave E, Haguenauer A, Rocher C, Ereskovsky A, Borchiellini C, Renard E. The Conservation of the Germline Multipotency Program, from Sponges to Vertebrates: A Stepping Stone to Understanding the Somatic and Germline Origins. Genome Biol Evol. 2017 Mar 1;9(3):474-488. doi: 10.1093/gbe/evw289.

3. Ilya Borisenko, Marcin Adamski, Alexander Ereskovsky and Maja Adamska. Surprisingly rich repertoire of Wnt genes in the demosponge Halisarca dujardini // BMC Evolutionary Biology. 2016. Vol.16, p. 123.

4. Alexander V. Ereskovsky, Ilya E. Borisenko, Pascal Lapébie, Eve Gazave, Daria B. Tokina, Carole Borchiellini. Oscarella lobularis (Homoscleromorpha, Porifera) Regeneration: Epithelial Morphogenesis and Metaplasia // PLoS ONE. 2015. 10(8): e0134566

5. Borisenko IE, Adamska M, Tokina DB, Ereskovsky AV. Transdifferentiation is a driving force of regeneration in Halisarca dujardini (Demospongiae, Porifera) // PeerJ. 2015. 3:e1211

Гранты

СПбГУ: 1.41.1114.2017, 1.41.1437.2014, 1.38.209.2013, 1.42.414.2013, 1.41.2273.2013, 1.42.1693.2011.
РФФИ: 16-04-00084-а, 13-04-01084-а, 10-04-91053-НЦНИ_а.
РНФ: 17-14-01089.

Сотрудничество с внешними организациями

Institut Méditerranéen de Biodiversité et d’Ecologie marine et continentale (France): Dr. Emmanuelle RENARD, PhD; Dr. Carole BORCHIELLINI, PhD

Московский государственный университет (Россия): Андрей Игоревич Лавров, к.б.н.

Australian National University, Research School of Biology (Australia): Dr. Maja Adamska, PhD
RIKEN-KFU Translational Genomics Unit (Japan): Dr. Oleg Gusev, PhD